К началу XIX века Стерлитамак превратился в преимущественно купеческий город. Статистика впечатляет: купеческая прослойка составляла седьмую часть населения — необычайно высокая для городов Уфимской губернии цифра. Более того, половина всех купцов Уфимской губернии жила именно в Стерлитамаке.
Стерлитамакское купечество установило устойчивые торговые связи со всеми уездными городами Оренбургской губернии, Поволжья, Сибири и Средней Азии. В октябре и феврале в городе проводились крупные ярмарки, собиравшие торговцев с огромной территории.
В сентябре 1824 года в Стерлитамаке произошло важное историческое событие: город посетил император Александр I, следовавший из Оренбурга в Уфу для осмотра уральских горных заводов. Народ приветствовал монарха в церкви, приветственную речь произнёс священник Фёдор Иванович Базилевский. Для императора собрали сведения о городе: в Стерлитамаке насчитывалось 298 деревянных домов и 2 490 жителей, «фабрик значительных нет, зданий, заслуживающих внимания, нет». Несмотря на скромность показателей, сам факт императорского визита свидетельствовал о возросшем значении города.
В 1831 году Стерлитамак впервые столкнулся с эпидемией холеры — за три летних месяца умерли 368 человек. Зимой 1834 года «по недосмотру» сгорела деревянная церковь. Эти трагедии подтолкнули стерлитамакское купечество к благотворительности. На пожертвования купцов Владимирцева, Сухорукова, Елисеева и горожан началось строительство каменного собора иконы Казанской Божьей Матери. Заложенный 29 июля 1837 года по проекту губернского архитектора Г. Алфеева, собор был освящён в 1850 году, а окончательно строительство завершилось в 1864 году.
Пятиглавый каменный собор с четырёхъярусной колокольней стал архитектурным центром города и символом его процветания. На средства Ивана Базилевского был отлит 200-пудовый колокол, звон которого был слышен на много вёрст вокруг. К сожалению, в 1937 году, ровно через сто лет после начала строительства, собор был разрушен.
В конце XIX — начале XX века купеческий Стерлитамак активно застраивался. Крупные купеческие династии — Утямышевы, Патрикеев, Самойловы — возводили доходные дома и торговые комплексы. Василий Григорьевич Патрикеев построил грандиозный двухэтажный доходный дом с кирпичным фасадом натурального цвета площадью почти три тысячи квадратных метров — первое в Стерлитамаке коммерческое здание такого масштаба.